HDDは発明された当初はかなりの大型の機械で、だんだん小型化が進み、現在ではデスクトップ用に3.5インチ、ノート用に2.5インチという大きさに落ち着いています。

　＊PCで使うのはほぼこのどちらかの大きさ

おそらく今後もこの3.5インチと2.5インチの大きさが主流のままでしょう。

デスクトップ用の3.5インチHDDは、もちろんケースの3.5インチシャドウベイに取り付けます。

ケースの3.5インチシャドウベイの大きさは当然3.5インチ幅なので、2.5インチのHDDは取り付けることができませんが、大きさを変換するマウンタを利用すれば2.5インチHDDも3.5インチベイに取り付けることが可能です。

　＊HDDに取り付けて大きさを変える変換マウンタ

　＊左がマウンタを取り付けて3.5インチに変換した2.5インチHDD
　右の3.5インチHDDと同じ幅になった

この他にも、3.5インチHDDを変換マウンタで光学ドライブなどを取り付ける5インチベイに取り付けることなども可能です。

こういった変換マウンタを活用すれば、ケースのベイが足りない場合に、HDDを光学ドライブ用のベイに取り付けたり、パソコンの消費電力を減らすためにデスクトップでノート用のHDDを使用したりすることができます。

2.5インチのHDDでは厚みも重要なポイントとなります。
基本的にノートパソコンで使用されるHDDは2.5インチの9.5mm厚ですが、2.5インチHDDにはたまに省電力デスクトップ用などの12.5mm厚の製品があります。
3mmも厚くなると当然ノートパソコンには入らないので注意してください。

また、大きさによってネジ穴の位置も決まっています、3.5インチHDDは側面に6つと底面に4つの計10箇所、2.5インチHDDは側面に4つと底面に4つの計8箇所ネジ穴があります。

　＊3.5インチHDDの側面には3つずつ、両側に計6箇所の穴があいており通常はこのうち4箇所を使う

　＊裏面にもネジ穴が空いており、このネジ穴を使う場合もある

ケースや本体によって、どこのネジ穴を使うかは変わってきますが4箇所をネジ止めすることで固定されます。